Introducción: El embarazo en la adolescencia es un problema para la salud pública actual; constituye un riesgo obstétrico y perinatal importante, por ser causa de elevada morbilidad y mortalidad materna e infantil, que incluye defectos congénitos y problemas del desarrollo tanto físico como mental.Objetivo: Evaluar la frecuencia de defectos congénitos en embarazadas adolescentes, para proponer una estrategia educativa preventiva desde la atención primaria de salud. Material y método: Se realizó un estudio observacional analítico, transversal en el universo de 1 030 embarazadas adolescentes incluidas al Registro Estadístico de Evaluación de los Programas del Centro Provincial de Genética de Pinar del Río, desde enero del 2012 a diciembre del 2016. Resultados: Los defectos congénitos estuvieron presentes en el 1% de los embarazos. La frecuencia al nacimiento evidenció que los defectos del sistema cardiovascular y del tubo neural aportaron las mayores prevalencias. El embarazo en la adolescencia incrementó dos veces el riesgo de defectos congénitos de cardiopatías congénitas. (OR=2.04) Se propuso una estrategia educativa- preventiva dirigida al control del embarazo en la adolescencia desde la atención primaria de salud con el apoyo de la dirección provincial de educación, consulta de planificación familiar y los equipos básicos de trabajo. Conclusiones: El trabajo conjunto de la red de genética y la atención primaria de salud permiten desarrollar estrategias dirigidas al control y disminución de los riesgos de defectos congénitos y del embarazo en la adolescencia.