Introducción El desarrollo de la citogenética molecular a través de la hibridación in situ por fluorescencia (FISH, por sus siglas en inglés) se convirtió en un avance importante en el diagnóstico de las neoplasias hematológicas. Es una herramienta más para definir el diagnóstico, predecir el pronóstico y evaluar respuesta al tratamiento de estas enfermedades. Objetivo Describir las alteraciones cromosómicas detectadas en pacientes con neoplasias hematológicas a partir de la introducción de esta técnica. Método Se realizó estudio en 348 muestras de sangre medular de pacientes con neoplasias hematológicas, recibidas en el Laboratorio de Citogenética del Instituto de Hematología e Inmunología, en el período comprendido entre julio de 2014 y abril de 2017. Se utilizó la técnica de FISH con las sondas fluorescentes específicas. Resultados Con la sonda LSI BCR/ABL se observaron 36 casos positivos de leucemia mieloide crónica y los 16 pacientes con leucemia linfoide aguda fueron negativos. Se marcaron con sonda PML/RARA 38 muestras con diagnóstico de leucemia promielocítica al inicio de la enfermedad y 24 fueron positivas. Con la sonda ETV6/RUNX1 resultaron positivas 17 muestras. Se observaron 3 casos positivos a la deleción 7q31 y tres muestras a la deleción 13q14. Conclusiones Con la incorporación del FISH en el laboratorio nos ha permitido una mayor especificidad, sensibilidad y rapidez en la caracterización genética de las hemopatías malignas.