Introducción: En el año 2005, inicia en el Centro Nacional de Genética Médica de Cuba, la confirmación diagnóstica de los casos detectados por tecnología SUMA en el Programa de Pesquisa Neonatal de Galactosemia y Deficiencia de Biotinidasa. La Galactosemia, desorden metabólico con patrón de herencia autosómico recesivo, que se caracteriza por presentarse con vómitos, diarreas,  ictericia, letargia, hepatomegalia, daño renal y sepsis. El déficit de Biotinidasa es una enfermedad de herencia autosómica recesiva, cuyos pacientes afectados pueden presentar crisis convulsivas, hipotonía, ataxia, alopecia y problemas neurológicos. Objetivos: Describir los resultados obtenidos en el diagnóstico confirmatorio de Deficiencia de Galactosa y Biotinidasa en el CNGM en el período de cinco años. Materiales y Métodos: El método empleado en la confiramación del déficit de biotinidasa se basa en la determinación espectrofotométrica de los niveles de ácidos p-aminobenzoico, liberados producto de la acción hidrolítica de la enzima. La cuantificación de galactosa y el estudio enzimático se realiza por  métodos espectrofotométricos descritos por Wallerfils K y Russel Mars, respectivamente.  Para ambos estudios se utilizaron muestras positivas en el programa de pesquisa (SUMA). Resultados y Discusión: Se confirmaron y diagnosticaron 5  casos positivos de Galactosemia (8,5%) y 6 de Biotinidasa (2,2%) para un 99,6% de cobertura del programa a nivel nacional. Conclusiones: El análisis confirmatorio constituyó una herramienta clave para el diagnóstico de estas enfermedades. Permitió el inicio oportuno del tratamiento, así como el  asesoramiento genético a los padres para próximos embarazos y un diagnóstico de certeza a los casos con sospecha de riesgo genético.