Introducción:La esquizofrenia es un trastorno mental con una frecuencia del 1 % a nivel mundial, estudios epidemiológicos sobre esta enfermedad reportan sistemáticamente que constituye un problema de salud pública de primera magnitud a nivel mundial. Objetivo:Identificar presencia de aberraciones cromosómicas estructurales en posible asociación con la esquizofrenia en pacientes cubanos, estimar la frecuencia de aparición de aberraciones cromosómicas estructurales, describir el tipo de aberracionescromosómicas según sean: balanceadas, no balanceadas. Materiales:Se realizó un estudio descriptivo del tipo serie de casos,el universo de estudio estuvo conformado por todos los individuos con esquizofrenia evaluados por el proyecto “Localización de marcadores genéticos de susceptibilidad asociados al origen de la esquizofrenia en la población cubana” y que cumplieron los criterios propuestos por el Manual Diagnóstico y Estadístico de los Trastornos Mentales, la muestra fue conformada por 301 pacientes de diferentes hospitales psiquiátricos y de hospitales clínicos quirúrgicos con servicio de psiquiatría en el país.Resultados:Se identificaron alteraciones nunca antes reportadas, como: duplicaciones en los cromosomas 5, 7 y 10, adiciones en los cromosomas 14 y 21 y translocaciones entre los cromosomas 5 y 9. Conclusiones: Este estudio demuestra la posible asociación de las alteraciones cromosómicas estructurales y la esquizofrenia en la población cubana,los hallazgos presentados son de absoluta novedad en Cuba y hasta el momento constituyen la única evidencia de esta naturaleza en la literatura científica cubana, lo cual aporta al conocimiento en dos especialidades médicas: la psiquiatría y la genética clínica.